Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL2P19875 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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