Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNNI3P19429 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNNI3P19429 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms