Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN1P18031 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN1P18031 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms