Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS1P17812 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms