Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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