Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms