Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNAP12004 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNAP12004 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNAP12004 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNAP12004 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNAP12004 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNAP12004 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNAP12004 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNAP12004 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNAP12004 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNAP12004 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNAP12004 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNAP12004 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNAP12004 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCNAP12004 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNAP12004 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PCNAP12004 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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PCNAP12004 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PCNAP12004 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PCNAP12004 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PCNAP12004 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNAP12004 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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