Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBL4AP11441 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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