Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJB1P08034 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJB1P08034 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJB1P08034 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJB1P08034 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJB1P08034 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJB1P08034 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms