Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms