Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms