Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRICKLE3O43900 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms