Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB3O43889 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREB3O43889 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREB3O43889 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CREB3O43889 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms