Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms