Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKAB2O43741 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKAB2O43741 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKAB2O43741 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKAB2O43741 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKAB2O43741 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKAB2O43741 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKAB2O43741 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKAB2O43741 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKAB2O43741 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKAB2O43741 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKAB2O43741 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKAB2O43741 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms