Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms