Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNMO15061 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNMO15061 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNMO15061 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNMO15061 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNMO15061 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNMO15061 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNMO15061 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNMO15061 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNMO15061 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms