Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F3O00716 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F3O00716 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F3O00716 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F3O00716 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F3O00716 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F3O00716 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F3O00716 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.5 ms