Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVV-2B6SEH9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms