Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ISM1B1AKI9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms