Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms