Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms