Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2J1Q9Y385 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2J1Q9Y385 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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