Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP20Q9Y2K6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP20Q9Y2K6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
USP20Q9Y2K6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP20Q9Y2K6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
USP20Q9Y2K6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
USP20Q9Y2K6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP20Q9Y2K6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP20Q9Y2K6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP20Q9Y2K6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP20Q9Y2K6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP20Q9Y2K6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP20Q9Y2K6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP20Q9Y2K6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP20Q9Y2K6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP20Q9Y2K6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms