Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD1BQ9UPS6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms