Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A4Q9UP95 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms