Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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