Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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