Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms