Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIN28AQ9H9Z2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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