Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
COMMD5Q9GZQ3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
COMMD5Q9GZQ3 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms