Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASXL3Q9C0F0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ASXL3Q9C0F0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms