Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms