Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM5Q9C035 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms