Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ROPN1BQ9BZX4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms