Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC4A5Q9BY07 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC4A5Q9BY07 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms