Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP58Q9BVL2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP58Q9BVL2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms