Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf50Q9BV19 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms