Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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C9orf16Q9BUW7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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C9orf16Q9BUW7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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C9orf16Q9BUW7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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C9orf16Q9BUW7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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C9orf16Q9BUW7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf16Q9BUW7 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf16Q9BUW7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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