Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms