Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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