Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF3RQ99062 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF3RQ99062 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms