Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRBNQ96SW2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms