Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFT140Q96RY7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms