Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms