Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms