Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LCORQ96JN0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LCORQ96JN0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LCORQ96JN0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LCORQ96JN0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LCORQ96JN0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LCORQ96JN0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LCORQ96JN0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LCORQ96JN0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LCORQ96JN0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LCORQ96JN0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LCORQ96JN0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LCORQ96JN0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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