Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms