Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CNTNAP2-201ENST00000361727 9896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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