Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RPAP2Q8IXW5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms